Diferencies ente revisiones de «Química computacional»

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En [[1964]], cálculos del [[métodu Hückel]], que son un simple métodu [[Métodu d'orbitales moleculares como una combinación llineal d'orbitales atómicos|CLOA]] pa la determinación de la enerxía d'electrones d'órbites moleculares de <math>\pi</math> electrones en sistemes conxugaos d'hidrocarburos, que van dende sistemes senciellos tales como'l [[1,3-butadieno|butadieno]] o'l [[bencenu]] hasta'l [[ovaleno]] con 10 aníos fundíos d'a 6, fueron xeneraos en computadores en [[Universidá de California, Berkeley|Berkeley]] y [[Universidá d'Oxford|Oxford]].<ref>Streitwieser, A.; Brauman J. I. and Coulson C. A. (1965). ''Supplementary Tables of Molecular Orbital Calculations''. Oxford: Pergamon Press.</ref> Estos métodos empíricos fueron reemplazaos nos [[Años 1960|60']] por [[Métodos semi-empíricos de química cuántica|métodos semi-empíricos]] tales como [[CNDO]].<ref>Pople, John A.; David L. Beveridge (1970). ''Approximate Molecular Orbital Theory''. New York: McGraw Hill.</ref>
 
A empiezos de los [[Años 1970|70']], eficientes programes computacionales ''ab initio'' tales como [[ATMOL]], [[Gaussian]], [[IBMOL]] y [[POLYAYTOM]] empiecen a ser utilizaos p'acelerar los cálculos ''ab initio'' d'órbites moleculares. D'estos programes namánamái Gaussian, masivamente espandíu, ta entá n'usu, siendo unu de los tantos utilizaos anguaño. Coles mesmes, los métodos de [[mecánica molecular]], tales como [[MM2]], fueron desenvueltos principalmente por [[Norman Allinger]].<ref>Allinger, Norman (1977). "Conformational analysis. 130. MM2. A hydrocarbon force field utilizing V1 and V2 torsional terms". ''Journal of the American Chemical Society'' '''99''': 8127-8134.</ref>
 
Una de les primeres vegaes que'l términu "química computacional" foi mentáu pue ser atopáu nel llibru ''Computers and Their Role in the Physical Sciences'' de [[1970]], escritu por [[Sidney Fernbach]] y [[Abraham Haskell Taub]], onde dicen: "Paez, poro, que la 'química computacional' puede finalmente ser más y más una realidá".<ref>Fernbach, Sidney; Taub, Abraham Haskell (1970). ''Computers and Their Role in the Physical Sciences''. Routledge. ISBN 0-677-14030-4.</ref> Mientres los 70', distintos métodos empiecen a ser vistos como parte d'una nueva disciplina emerxente de ''química computacional''.<ref>[http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/bookhome/114034476 Reviews in Computational Chemistry vol 1, preface].</ref> La primer publicación del jornal de química computacional foi publicáu en [[1980]].
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El términu "''química teórica"'' puede ser definíu como una descripción matemática de la química o, en forma más amplia, tomando tol andamiaxe conceptual que traviesa les [[Teoría|teoríes]], [[Concepto|concepto]] y modelos de la [[química]] (este ye una tema n'alderique dientro del terrén de la [[filosofía de la química]]), ente que'l términu "''química computacional'' " ye usualmente usáu cuando un métodu físicu-matemáticu ta lo suficientemente bien desenvueltu pa la so aplicación a sistemes moleculares en forma relativamente automatizada, implementáu nun paquete computacional. Magar bien pocos aspeutos de la química pueden ser calculaos de manera esacta, estes metodoloxíes tienen erros abondo bien definíos contra los datos esperimentales esistentes, que dexen la determinación de propiedaes moleculares dientro de lo que se conoz como "precisión química". Sicasí, casi cualquier aspeutu de la química puede ser descritu de manera cualitativa, semi-cuantitativa o inclusive cuantitativamente por aciu un esquema computacional.
 
Les molécules tán conformaes por núcleos atómicos y electrones, de manera que la teoría y modelos de la [[mecánica cuántica]] pueden ser aplicaos a la so descripción. Lo más frecuente ye que los químicos computacionales plantegen y resuelvan la [[ecuación de Schrödinger]] non relativista, incorporando ''a posteriori'' correcciones relativistes cuando esto ye indispensable pa llograr una correcta descripción del sistma. Teóricamente, ye posible resolver en forma esacta la ecuación de Schrödinger molecular, yá sía na so forma dependiente del tiempu o na so forma independiente del tiempu, pero na práctica esto namánamái ye posible pa sistemes bien pequenos. Poro, desenvolviéronse una gran variedá de métodos averaos empobinaos a algamar el meyor equilibriu ente la viabilidá del cálculu, el so costo y la precisión de la resultancia llograos. La precisión puede siempres ser ameyorada amontando'l costo computacional. La química computacional actual dexa calcular con exactitú de manera rutinaria les propiedaes de les molécules que contienen cientos d'átomos (y los electrones correspondientes), con erros pa la enerxía que pueden tar per debaxo de 1 kcal/mol. Tocantes a los aspeutos estructurales a nivel atómicu (la xeometría molecular) ye posible predicir llargores d'enllaz con erros d'unos pocos [[picómetro]]s (pm) y los ángulos d'enllaz con erros del orde de <math>0.5^\text{o}</math>. El tratamientu de grandes molécules ye computacionalmente abordable por aciu otros métodos averaos tales como los basaos na [[teoría del funcional de la densidá]] (DFT, del inglés ''density functional theory''). Esiste dalgún discutiniu nel campu sobre si los métodos teóricos son abondo esactos pa describir reacciones químiques complexes, como les arreyaes en problemes de la [[bioquímica]]. Les macromoléculas pueden ser estudiaes per mediu de métodos cuánticos semi-empíricos o por métodos de la [[mecánica clásica]], tamién llamaos métodos de [[mecánica molecular]].(MM).
 
Na química teórica, químicos, físicos, matemáticos ya informáticos desenvuelven modelos, [[algoritmu|algoritmos]] y [[software]] pa predicir propiedaes atómiques y moleculares y p'atopar mecanismos de [[Reacción química|reacciones químiques]]. Otra manera, los químicos computacionales empleguen programes y metodoloxíes esistentes pa dar respuesta a entrugues químiques específiques.
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Una mesma fórmula molecular puede representar un númberu ampliu de [[Isomería|isómeros]]. Cada isómero corresponder con un mínimu local de la superficie d'enerxía potencial del sistema molecular (resultante de considerar la enerxía de los electrones más la enerxía de repulsión nuclear) como una función de les coordenaes nucleares. Un puntu estacionariu correspuende a una xeometría tal que la derivada de la enerxía con al respective de tolos desplazamientos de los núcleos val cero. Un mínimu local (d'enerxía potencial molecular) ye un puntu estacionariu pal que tolos desplazamientos nucleares conducen a un aumentu de la enerxía, polo tanto acomuñar con formes estables del sistema. El mínimu local de nás baxa enerxía ye llamáu mínimu global y correspuende al isómero más estable. Cuando un cambéu nuna coordenada en particular de la estructura lleva a un amenorgamientu de la enerxía total en dambes direcciones, el puntu estacionariu correspuende a un [[estáu de transición]] y la coordenada pa la que ye un máximu, ye la [[coordenada de reacción]]. Esti procesu de determinar los puntos estacionarios ye llamáu optimización xeométrica.
 
La determinación de la estructura molecular vía optimización xeométrica convertir nuna rutina namánamái cuando métodos eficientes pal cálculu de la primer derivada de la enerxía con al respective de toles coordenaes atómiques tuvieren disponibles. La evaluación de les segundes derivaes dexa la predicción de les frecuencies vibratories suponiendo movimientos harmónicos. Les frecuencies tán rellacionaes colos [[Vector propiu y valor propiu|valores propios]] de la matriz de segundes derivaes (la [[matriz hessiana]]). Si los valores propios son toos positivos, entós les frecuencies son toes reales y el puntu estacionariu ye un mínimu local. Si un valor propiu ye negativu (una frecuencia imaxinaria), el puntu estacionariu ye un estáu de transición. Si más d'un valor propiu ye negativu'l puntu estacionariu ye más coplejo entá, y usualmente de poco interés. Cuando s'atopa, ye necesariu mover la busca fora d'él, si ta buscándose un mínimu local y un estáu de transición.
 
La enerxía total ta determinada por una solución averada de la ecuación de Schrödinger dependiente del tiempu, usualmente incluyendo términos non relativistes, y faciendo usu de la [[aproximamientu de Born-Oppenheimer]], que, basada nes más altes velocidaes de los electrones en comparanza colos núcleos, dexando la separación de movimientos electrónicos y nucleares, simplificando la ecuación de Schrödinger. Esto conduz a la evaluación de la enerxía total como una suma d'enerxía electrónica nes posiciones fixes del núcleu más la enerxía de repulsión del mesmu. Una notable esceición constituyir los enfoques llamaos [[química cuántica directa]], que traten a los electrones y los núcleos por igual. Métodos del [[funcional de densidá]] y métodos semi-empíricos son variantes de la tema principal. Pa cada sistema grande, la enerxía total relativa pue ser comparada utilizando mecánica molecular. Les formes de determinar la enerxía total pa predicir la estructura molecular son:
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== Softwares químicos ==
Hai munchos autosuficientes usaos por químicos computacionales. Dalgunos inclúin munchos métodos cubriendo una amplia gama de conceutos, ente qu'otros cubren namánamái una área específica y otros inclusive un simple métodu. Los detalles d'éstos pueden atopase en:
* [[Programes computacionales de química cuántica]].
* Programes de la [[Teoría del funcional de la densidá#Software d'ayuda pa DFT|teoría del funcional de la densidá]].