Diferencies ente revisiones de «Filoxenética molecular»

== Antecedentes Tolos organismos contienen ADN, [[ARN]], y [[proteínes]]. Polo xeneral, los organismos estrechamente rellacionaos tienen un altu grau de concordanza nes estructures moleculares, ente que les secuencies d'organismos distantemente rellacionaos suelen amosar un patrón de desemeyanza. Secuencies calteníes, tales como les del ADN mitocondrial, espérase qu'atropen mutaciones a lo llargo del tiempu, y asumiendo qu'estes mutaciones producir a una tasa constante, aproven un [[reló molecular]] pa datar diverxencia. La filogenia molecular usa datos como esos pa construyir un ''árbol de relaciones'' qu'amuesa la probable evolución de dellos organismos. Cola invención del [[métodu de Sanger]]<ref name=Sanger75>{{cite journal |author=Sanger F, Coulson AR |title=A rapid method for determining sequences in DNA by primed synthesis with DNA polymerase |journal=J. Mol. Biol. |volume=94 |issue=3 |pages=441–8 |date=May 1975 |pmid=1100841 |doi=10.1016/0022-2836(75)90213-2 }}</ref><ref name="Sanger1977">{{cite journal |author=Sanger F, Nicklen S, Coulson AR |title=DNA sequencing with chain-terminating inhibitors |journal=Proc. Natl. Acad. Sci. O.S.A.|volume=74 |issue=12 |pages=5463–7 |date=December 1977 |pmid=271968 |pmc=431765 |doi=10.1073/pnas.74.12.5463 |bibcode = 1977PNAS...74.5463S }}</ref> en 1977 foi posible aisllar ya identificar estes estructures moleculares. <br />▼

Una filogenia puede representase en forma de ''árbol'', que contién nodos que conecten cañes ente sigo. Estos nodos y cañes pueden representar distintos eventos, procesos, o relaciones. Dependiendo del árbol filogenético, por casu: los nodos podríen representar eventos de [[especiación]], y les cañes, les relaciones ente los distintos grupos. <br />▼

Los primeros intentos en sistemática molecular denomináronse [[quimiotaxonomía]] la cual faía usu de proteínes, [[enzimes]], [[carbohidratos]] y otres molécules, que yeren dixebraes por aciu técniques como la [[cromatografía]]. Les mesmes fueron reemplazaes llargamente por técniques de secuenciación les cualos son capaces de revelar la secuencia esacta d'ADN o ARN. Polo xeneral son técniques consideraes cimeres pa los estudios d'evolución por cuenta de que los cambeos evolutivos tán bien reflexaos nel [[códigu xenéticu]]. Puede llograse con relativa facilidá la secuencia d'una determinada área del [[xenoma]]. La sistemática molecular típica rique de la secuenciación de fragmentos d'alredor de 1000 pares de bases. En cualquier rexón de la secuencia, les bases d'un organismu pueden variar al respective de les d'otru. La secuencia particular d'un organismu ye denomada ''[[haplotipo]]''. Como esisten 4 tipos distintos de bases, nuna rexón de 1000 pares de bases podemos tener 4^1000 tipos distintos de haplotipos. Sicasí atopóse que nos organismos d'una especie o d'un grupu d'especies rellacionaes les variaciones son relativamente pequeñes, faciendo que'l númberu de haplotipos distintos sía relativamente pequeñu al respective de la cantidá de haplotipos posibles. <br />▼

Xeneralmente úsase una amuesa sustancial d'individuos de la especie oxetivu d'estudiu y tamién los individuos d'otru [[taxón]], sicasí, munchos estudios nel presente solo usen la secuencia d'un individuu. Los haplotipos ente los individuos d'una especie son distintes, pero estrechamente rellacionaos, sicasí, el haplotipo del taxón esternu ye notablemente distintu. Les bases de les secuencies de los distintos organismos pueden ser comparaes por aciu l'alliniadura de secuencies. Nos casos más simples, les diferencies ente dos haplotipos pueden considerase como les rexones de les secuencies onde hai distintes bases. Esto suel llamar como cantidá de sustituciones, insertamientos o deleciones. La diferencia ente organismos suelse espresar como porcentaxe de diverxencia, estremando'l númberu de sustituciones pol total de bases comparaes: asumir qu'esta midida va ser independiente de la localización y llargor de la seición d'ADN analizada, sicasí sábese qu'en realidá esisten esceiciones a esta xeneralización. <br />▼

Nun aproximamientu más antiguu determinábase la diverxencia ente los xenotipos d'individuos por aciu técniques de [[Hibridación (bioloxía molecular)|hibridación]] ADN-ADN.<ref>{{cite journal|author=Ahlquist, Jon Y.|year= 1999|title= Charles G. Sibley: A commentary on 30 years of collaboration|journal=The Auk|volume=116|issue=3|url=http://sora.unm.edu/node/26122|pages=856–860|doi=10.2307/4089352 }}</ref> La ventaya d'esti métodu por sobre la secuenciación de xenes basar na comparanza del xenotipu enteru, más que solo nuna seición del ADN. La comparanza de múltiples secuencies de xenes nel presente fixo que la ventaya antes mentada pierda valor. <br />▼

Una vegada determinada la diverxencia ente tolos pares de bases, la matriz triangular de diferencies resultante ye analizada por técniques estadístiques de determinación de grupos, y el [[dendrograma]] resultante ye esamináu pa ver cómo s'arrexunten les amueses. Tolos grupos de haplotipos que son más similares ente sí que colos haplotipos d'otru grupu van ser quien compongan un determináu clado. Les técniques estadístiques como ''[[Bootstrapping (estadística)|bootstrap]]'' y ''[[jacknife (estadística)|jacknife]]'' ayuden aproviendo la confiabilidad envalorada pa cada haplotipo dientro de los árboles filogenéticos. <br />▼