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Entamó una investigación d'ensayu y error mientres 4 años y n'estudiando meticulosamente les enfermedaes del vierme de seda pudo entender los mecanismos d'andada. Por aciu el [[microscopiu]] afayó que realmente nun teníen una enfermedá, sinón dos, provenientes de dos talos [[parásitu|parásitos]] qu'infectaben a los viermes y fueyes de que s'alimentaben. El so diagnósticu foi drásticu: los viermes y fueyes infectaes teníen que ser destruyíos y reemplazaos por otros nuevos. Por aciu una rigorosa seleición pudo aisllar un grupu sanu y curió que nun s'arimara. Sicasí, non tou resultaba bien para Pasteur: sufrió una hemorraxa cerebral que la dexó casi hemipléxicu del llau esquierdu. En cuanto convaleció publicó un llibru nel que detallaba los sos ensayos y descubrimientos, conocencia qu'otros países nun tardaron n'aplicar. Yá entós la industria local de la seda recoyía los frutos del so apurra y llograba ganancies per primer vegada nuna década, y países como Australia ya Italia asonsañaben llargamente la so técnica de seleición.<ref name=diez />
 
El descubrimientu de la cura de la enfermedá de los viermes de seda aumentó la so fama y atraxo la so atención escontra'l restu de d'[[enfermedá|enfermedaes]]es contaxoses. La idea de que les enfermedaes pueden ser tresmitíes ente criatures vivientes rescamplaba nes epidemies, como'l [[biltu de cólera de 1854 na cai Broad]], Londres, que cobró la vida de 500 persones nun escasu radiu de 200 metros. Por aciu la interrogación de los infectaos y el siguimientu epidemiolóxicu de l'andada, [[John Snow]] llogró identificar l'orixe del biltu una fonte d'agua público. Snow convenció a les autoridaes de que clausuraren el pozu y l'epidemia cesó. Sicasí, la idea d'una enfermedá contaxosa nun resultaba obvia pa la población, pos topetaba col pensamientu de la dómina. La pieza que faltaba pa dar coherencia a esta llinia de pensamientu y resolver los sos puntos débiles ya inesplicables yera afayar qué yera esactamente'l tramisor de la enfermedá.<ref name=diez />
 
Nestes circunstancies demostró esperimentalmente y desenvolvió la [[teoría xerminal de les enfermedaes infeicioses]], según la cual toa enfermedá infeiciosa tien la so causa ([[etioloxía]]) nun ente vivu [[microscópicu]] con capacidá p'arrobinase ente les persones, amás de ser el causante de procesos químicos como la [[descomposición]] y la [[fermentadura]], y la so causa nun provenía d'adientro del cuerpu por cuenta de un [[Teoría de los cuatro humores|desequilibrio d'humores]] como se creía tradicionalente. La so teoría foi revesosa ya impopular: resultaba risible pensar que daqué insignificantemente pequeñu hasta lo invisible pudiera causar la muerte de seres muncho más «fuertes».<ref name=diez>{{Cita llibru|apellíos=Moledo|nombre=Leonardo|títulu=Diez teoríes que trescalaron al mundu: de Copérnico al big bang|añu=2009|añu-orixinal=Obra orixinal 2006|editorial=Capital Intelectual|isbn=9789876141673|allugamientu=Arxentín|apellíos2=Magnani|nome2=Esteban|capítulu=6. Pasteur y la teoría de la infeición microbiana|fechaacceso=17 d'agostu de 2013}}</ref>